Фамилия Навныка звучит нехарактерно для русской среды — в ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский. Это сразу указывает на украинское происхождение. В украинском языке фамилии на -ыка (-ика) встречаются чаще, чем в русском, и обычно образованы от прозвищ, характеризующих человека по поведению, привычке или какому-то яркому свойству.

Основа «навны» — почти наверняка искажённое или диалектное «навмисне», то есть «нарочно», «преднамеренно». В украинских говорах слово могло звучать как «навмисный», «навныка» — человек, который всё делает назло, с умыслом, или, наоборот, слишком настойчиво, упрямо. Такие прозвища давали не в обиду, а как меткую бытовую характеристику: «ну ты и навныка» — упрямец, который стоит на своём.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с польским «nawyk» (привычка, навык). Если предки жили на западе Украины, в зоне польского влияния, фамилия могла означать «привычный», «обычный» человек, но с тем же прозвищным оттенком. Однако украинская версия с «навмисне» выглядит убедительнее из-за характерного для восточнославянских говоров перехода «ми» в «ны».

Географически фамилия Навныка встречается прежде всего в центральных и западных областях Украины — в Винницкой, Хмельницкой, Житомирской областях. В России она редка, и если встречается, то почти всегда у потомков украинских переселенцев. Сословного барьера у фамилии не было: прозвище могли дать и крестьянину, и казаку, и мещанину.

Суффикс -ыка в украинских фамилиях часто несёт оттенок пренебрежительности или шутливости, как в фамилиях Нечитайло, Забуга, Крутихвост. Поэтому Навныка — это не просто «нарочный», а скорее «тот, кто любит делать назло», с лёгкой усмешкой. В современном языке фамилия звучит необычно, но в украинской ономастике это рядовая модель: от прозвища к фамилии без дополнительных суффиксов, напрямую.