Фамилия Наводченко — типичный пример восточноукраинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках закрепилась в среде реестрового казачества и крестьянства Левобережья. Суффикс -енко обозначал «сын» или «потомок», то есть Наводченко буквально означает «сын Наводки» или «сын того, кого прозвали Наводкой». Вопрос упирается в то, что такое «Наводка» — прозвище, а не имя.

Самая прямая версия — происхождение от слова «наводка» в значении «наведение, указание». В диалектах так могли назвать человека, который указывал путь, служил проводником, или, напротив, того, кто наводил беду, сглаз («наводка порчи»). В украинских говорах «наводка» — это также намек, подсказка, что могло относиться к хитрому, уклончивому собеседнику. Менее вероятно, но возможно, что прозвище связано с военным термином «наводка» (наводка орудия, моста) — тогда предок был наводчиком пушки или строителем переправ.

Спорный момент — связь с «наводнение», «вода». Фонетически «Наводченко» не выводится прямо из «наводнение»: там была бы основа «наводн-», а не «наводк-». Поэтому версия с водой — натяжка, её обычно предлагают из-за созвучия, но лингвистика её не поддерживает.

Фамилия редкая, не входит в топ-500 украинских фамилий. Основные очаги — Черниговская и Сумская области, а также юг России (Краснодарский край, Ростовская область), куда фамилия попала с переселенцами конца XIX — начала XX века. Встречаются единичные носители в Беларуси и Казахстане.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду с такими же: Наводка → Наводченко, как Коваль → Коваленко, Швець → Шевченко. Ударение, скорее всего, на второй слог: Наво́дченко, хотя в бытовой речи иногда смещается на третий. Письменных свидетельств XVII–XVIII веков с этой фамилией пока не обнаружено, поэтому точную дату появления назвать нельзя — она могла оформиться в середине XVIII века, когда суффикс -енко стал массовым.