Фамилия Наводниченко образована от прозвища Наводний, и в её основе лежит слово «наводнение» — затопление местности из-за подъёма воды в реке, озере или море. Такое прозвище чаще всего указывало на место жительства: предок мог жить в низине, на пойменных лугах или у самой воды, где разливы были привычным делом. Возможно также, что прозвище закрепилось за человеком, чей дом и хозяйство пострадали от большой воды, — подобные случаи в народе запоминались надолго и легко превращались в семейное имя.

Сама модель фамилии — типичная для украинской и южнорусской традиции. Суффикс -енко, изначально означавший «сын» или «потомок», присоединяли к прозвищу отца: Наводний → Наводниченко, то есть «сын Наводния». Такие фамилии массово закреплялись в казацкой среде и среди крестьянства на Левобережной Украине, в Поднепровье и на Слобожанщине, откуда позднее распространились по всей России.

Интересно, что прозвище Наводний не было личным именем, а скорее уличным прозванием. В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища нередко сосуществовали с крестильным именем, а затем полностью заменяли его в быту и официальных записях. Так и здесь: наследственное имя, данное при крещении, со временем уступило место прозвищу, которое точнее описывало человека или его окружение.

Стоит оговориться: версия о связи с наводнением — основная, но не единственная. В говорах слово «наводный» могло иметь и другие оттенки, например, относиться к воде как таковой, к человеку, живущему у воды, или даже к тому, кто занимался переправой. Однако прямая связь с наводнением остаётся самой правдоподобной: она проста, естественна и хорошо объясняет, почему прозвище возникло именно в речных или озёрных краях.

Фамилия Наводниченко не относится к числу древних аристократических родов — это фамилия народная, крестьянская и казацкая. Она не попала в старинные боярские списки, но это не умаляет её ценности: такие фамилии хранят память о быте, ландшафте и судьбах простых людей, для которых вода была и кормилицей, и угрозой.