Фамилия Наймытенко — характерный пример украинской фамилии с прозрачной, но неочевидной на первый взгляд основой. Судя по суффиксу -енко, она образована на территории, где господствовала украинская ономастическая модель: -енко (и его варианты -ченко, -иченко) означает «сын» или «потомок». Центр распространения таких фамилий — Левобережная и Степная Украина, хотя отдельные носители встречаются и в южных областях России из-за переселений XIX–XX веков.

Корень «наймыт» — ключ к разгадке. В украинском языке «наймит» (через «и», а не «ы») — это батрак, наёмный работник, который трудился за плату и кров, не имея собственной земли. Фонетически «наймыт» — диалектный или исторический вариант этого слова, где «и» перешло в «ы» под влиянием южнорусских говоров или просторечного произношения. Таким образом, Наймытенко — буквально «сын батрака» или «потомок наёмного работника». Фамилия не дворянская и не казацкая старшина: она указывает на социальное положение предка в эпоху, когда прозвище закреплялось за родом.

В ономастике есть и альтернативная версия: связь с тюркским «найман» (название одного из средневековых племён). Но для фамилии Наймытенко эта гипотеза слабая — переход «найман» → «наймыт» требует искусственных допущений, а суффикс -енко типичен именно для украинской среды, где тюркские заимствования редки в чистом виде. Правдоподобнее считать, что перед нами бытовое прозвище по роду занятий, каких много: Бондаренко (от бондарь), Коваленко (от кузнец), Тесленко (от плотник). Наймытенко стоит в том же ряду, но с оттенком зависимости — батрак не ремесленник и не владелец мастерской.

В документах Российской империи фамилия фиксировалась в основном в Полтавской, Харьковской и Киевской губерниях, что совпадает с ареалом малоземельного крестьянства, которое часто шло в наймы. Со временем, когда социальное значение стёрлось, фамилия стала просто родовым именем, но её корень доносит до нас реалии аграрного уклада: человек, не имевший своего поля, жил чужим трудом, и это стало его семейным прозванием.