Фамилия Недтопа — редкий случай, когда значение лежит почти на поверхности. Она явно образована от прозвища, которое в основе своей содержит глагол «топать» с отрицанием «не». Недтопа — это человек, который не топает, то есть ходит тихо, бесшумно, крадучись. В русских говорах такое прозвище могли дать либо очень осторожному и незаметному человеку, либо, напротив, — с иронией тому, кто ходит тяжело и громко, «не топая» в смысле «не умея ступать легко». Второй вариант, с обратным смыслом, встречается в ономастике не реже первого.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Фамилия построена по схеме «глагол + отрицание», но без типичного для русских фамилий суффикса (-ов, -ин, -ский). Это так называемая «застывшая» форма прозвища, которая перешла в фамилию без изменений. Похожий принцип встречается у фамилий Непейвода, Неумывайко, Недогони. Такие бессуффиксные фамилии чаще всего фиксировались на юге России, в украинских и белорусских землях, где прозвища в именительном падеже легко становились наследственными.

Вероятнее всего, фамилия Недтопа имеет украинское или южнорусское происхождение. В пользу этого говорит и характерный для малороссийской ономастики отказ от суффикса при образовании фамилии от глагольной основы. Первым носителем мог быть человек, получивший прозвище за манеру ходьбы — тихую или, наоборот, грузную. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казацкой: в дворянской среде такие «говорящие» фамилии без оформления встречались редко.

Встречаются варианты написания Недтоп, Недтопов, но форма Недтопа — исходная, именительная. Фамилия очень редкая: в современных базах данных она почти не фиксируется, что говорит либо о её локальном бытовании, либо о почти полном исчезновении в результате миграций или смены фамилий в советское время.