Фамилия Негомедьянова — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а целое высказывание, отрицание. Её ядро — диалектный глагол «негомедить» или «негомедьянить», который в говорах русского Севера и Урала означал «бездельничать, шататься без дела, лениться». Суффикс -ян- указывает на лицо по действию: «негомедьян» — тот, кто негомедит, лодырь, бездельник. Притяжательный суффикс -ов (в женском роде -ова) закрепил фамилию за потомками этого человека: буквально «сын (или дочь) Негомедьяна».

Ударение в исходном прозвище, скорее всего, падало на второй слог: Негоме́дьян. В современном бытовании фамилия часто смещается на последний слог — Негомедья́нова, что свойственно многим фамилиям на -янов.

Образование по такой модели — отглагольное прозвище с отрицательной приставкой не- — встречается нечасто. Сравните с фамилиями Негодяев, Нелюбов, Непейвода, но в них основа обычно ясна без диалектных словарей. «Негомедить» — слово почти забытое; его фиксируют лишь областные словари XIX — начала XX века, например, в архангельских и вятских говорах. Это сразу указывает на географию корней: предки носительницы фамилии жили на Русском Севере или в Приуралье, где такое прозвище могли дать нерадивому работнику или ленивому парню.

В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), Негомедьянова — «характерологическая», то есть описывающая поведение. Прозвище давали не в наследство, а как меткую бытовую характеристику. Со временем оно закрепилось за родом, утратив первоначальную оценку, и стало нейтральным родовым именем.

Мужской вариант — Негомедьянов — встречается крайне редко, и оба варианта почти не имеют омонимичных корней: путаница с фамилиями на -мед-, вроде Медведев или Медников, маловероятна. Фамилия остаётся локальной, нечастотной и прозрачной для этимолога, но неочевидной для обычного носителя языка.