Фамилия Ненартонис — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет литовские корни. Её основа — литовское слово «nenartoti», что означает «не злиться», «не сердиться», «не раздражаться». Скорее всего, в основе лежит прозвище Ненартонис, которое дали спокойному, невозмутимому человеку, которого трудно вывести из себя. Это не описание характера в бытовом смысле, а скорее констатация: «тот, кто не гневается».

Обратите внимание на суффикс. Фамилия заканчивается на -ис, что типично для литовских фамилий в их исходной форме. В русском языке такие фамилии часто не склоняются по падежам (как и многие фамилии на -ко, -их). Если бы фамилия обрусела окончательно, она могла бы получить суффикс -ов или -ин и превратиться в Ненартонов или Ненартонин. Но этого не произошло: носители сохранили литовский суффикс, что указывает на относительно позднее вхождение фамилии в русскую среду, возможно, в XIX — начале XX века, когда литовские крестьяне получали паспорта и записывались с уже готовыми фамилиями.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи: современная Литва, Беларусь, Смоленская и Псковская области. Встречаемость крайне низкая — это штучная фамилия, не образующая гнёзд. В некоторых источниках упоминается, что в Литве существовал дворянский род Ненартонисов, но документальных подтверждений этому мало: скорее всего, это были однодворцы или застенковая шляхта — мелкопоместные дворяне, которые по статусу почти не отличались от крестьян, но имели личную свободу.

С точки зрения словообразования фамилия необычна тем, что в ней нет привычного для русского уха суффикса принадлежности. Она образована напрямую от прозвища с помощью литовского суффикса -is, который указывает на лицо — носителя признака. То есть Ненартонис — это буквально «Несердитый». Аналог в русском языке — фамилии вроде Незлобина, но с той разницей, что Ненартонис сохранила грамматику языка-источника.

Итог: фамилия означает «сын (или потомок) того, кто не злится», а предок был человеком с устойчивой психикой, которого в деревне, возможно, дразнили за чрезмерное спокойствие.