Фамилия Непушкина — женская форма фамилии Непушкин, и её разбор стоит начать с корня «пушк-», который сразу наводит на мысль о знаменитом поэте. Однако связь здесь не прямая и не биографическая. Основа «пушка» в древнерусском языке — это не только огнестрельное орудие, но и прозвище для человека полного, грузного, «надутого» (от глагола «пухнуть»). В этом значении слово бытовало в народной речи намного шире, чем в военном деле.

Приставка «не-» в фамилии Непушкин — классический случай образования отчества-прозвища с отрицанием. В русской ономастике такие формы часто давали человеку в насмешку или для контраста: Непушкин — буквально «не пушка», то есть не толстяк, не тяжеловес, а, напротив, худой, щуплый или подвижный. Иногда подобные фамилии возникали как антипрозвища: если в семье уже был Пушкин (полный человек), то его сына или родственника, который отличался стройностью, могли прозвать Непушкиным — «не такой, как тот Пушкин».

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: чей? — Непушкин, то есть сын человека по прозвищу Непушка или Непушкин. Форма «Непушкина» — это женский вариант, который закрепился за женщиной либо по мужу (жена Непушкина), либо по отцу (дочь Непушкина). В документах XVIII–XIX веков такие фамилии нередко писали с вариациями: «Непушкинъ» или «Непушкина», в зависимости от пола носителя.

Географически фамилия редкая. Основные следы ведут в центральные губернии России — Московскую, Тверскую, Ярославскую, где прозвища с отрицанием были особенно распространены среди крестьян и мещан. В дворянской среде Непушкины не фиксируются: это однозначно простонародная фамилия, образованная от бытового прозвища, а не от фамилии Пушкин. Путаница с «анти-Пушкиным» возникает только у неспециалистов — на самом деле корень здесь общий, но значение противоположное.

В современном русском языке фамилия сохраняет исходную семантику: она не имеет отношения к поэзии, а напоминает о том, что предок носителя был человеком не грузным, не «пушкой», а скорее худощавым и лёгким.