Фамилия Нерсесен — яркий пример армянской фамилии, образованной по патронимической модели, то есть от имени отца. В основе лежит мужское личное имя Нерсес, которое, в свою очередь, восходит к древнегреческому Нерсес (Νερσής), а ещё глубже — к иранскому или арамейскому корню, означающему «ночной страж» или «рождённый ночью». Армянская традиция давать такие имена связана с почитанием святого Нерсеса Великого, католикоса Армении IV века. Суффикс «-ен» в фамилии — это классический армянский показатель принадлежности, аналог русского «-ов» или «-ин». Он буквально означает «из рода Нерсеса» или «сын Нерсеса». Таким образом, первый носитель фамилии Нерсесен, скорее всего, был потомком человека по имени Нерсес.

Интересно, что в отличие от многих армянских фамилий, оканчивающихся на «-ян» (например, Нерсесян), форма «Нерсесен» встречается реже. Она характерна для западных диалектов армянского языка или для вариантов, зафиксированных в диаспоре, где иногда отсекали или заменяли конечное «-ян» под влиянием местных языков. Встречается и написание «Нерсесян», которое является более распространённым восточноармянским вариантом. Обе формы означают одно и то же, но «Нерсесен» может указывать на происхождение предков из Западной Армении (территория современной Турции) или из среды армян, переселившихся в Российскую империю через Крым или Северный Кавказ.

Географически фамилия Нерсесен не является массовой. Её можно встретить среди армянских общин в России, особенно на Кубани и в Ростовской области, а также в странах Закавказья. В дореволюционной России носители такой фамилии могли быть как мещанами или купцами, так и крестьянами — армянские фамилии не давали строгой сословной привязки. В отличие от русских фамилий на «-ов», которые часто образовывались от прозвищ или занятий, армянские фамилии на «-ен» почти всегда отсылают к имени конкретного предка, что делает историю рода более прозрачной: вы знаете, что вашего предка звали Нерсес.