Фамилия Нетишин — редкий пример, где основа не очевидна на первый взгляд. Она образована с помощью патронимического суффикса -ин, который в русской традиции указывал на принадлежность: «чей?» — Нетишин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Нетиша. Вопрос упирается в то, что такое «Нетиша» и откуда это слово взялось.

Самая прямая версия отсылает к топониму. На Украине есть город Нетишин (Хмельницкая область), известный с XVI века. Фамилия могла возникнуть у выходца из этого места: человека, переехавшего в другую местность, прозвали Нетишей по названию родного города, а его дети стали Нетишиными. Такая модель — «по названию населённого пункта без дополнительного суффикса» — встречается, хоть и нечасто. Сравните: фамилия Москвин (от «москвич») или Тверитин — но здесь основа просто Нетиш-.

Более сложная версия — от прозвища, связанного с глаголом «тишить» (успокаивать, утихомиривать) с отрицательной приставкой не-. «Нетиша» — человек, которого невозможно успокоить, беспокойный, непоседа. В диалектах встречалось слово «тиша» в значении «тихоня», а «нетиша» — его антоним. Однако эта гипотеза слабее: приставка не- в прозвищах обычно сливалась с корнем, но не часто образовывала фамилии на -ин.

Суффикс -ин указывает, что фамилия закрепилась в среде, где преобладала эта модель — в основном среди крестьян и мещан центральной России и украинских земель, бывших в составе Российской империи. Фамилия Нетишин не относится к дворянским (нет окончания -ский/-цкий) и не встречается в старых боярских списках. Скорее всего, её носители — потомки крестьян или ремесленников, получивших фамилию в XVIII–XIX веках при переписях.

Однокоренных фамилий почти нет. Иногда путают с фамилией Нетишев (от тюркского имени Нетиш?), но это другой корень. Встречаемость Нетишина крайне низкая: по открытым данным, в России фамилия сосредоточена в Белгородской и Воронежской областях — как раз на границе с Украиной, что косвенно подтверждает версию о географическом происхождении.