Фамилия Незлобина — женская форма фамилии Незлобин, а та образована от прозвища или мирского имени Незлоба. В основе лежит прилагательное «незлобивый» — кроткий, беззлобный, незлопамятный человек. В дохристианской и раннехристианской традиции на Руси такие «охранительные» имена (Незлоба, Немил, Неулыба) давали не в качестве характеристики, а как оберег: считалось, что имя-антипод отведет от ребенка злые силы и накличет противоположное качество. Незлобой могли назвать младенца, чтобы он вырос добрым и покладистым, или же, наоборот, закрепить за взрослым человеком его отличительную черту — мягкий нрав.

Словообразовательная модель фамилии стандартна для центральной и северной России: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Незлобы). В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с этим прозвищем, например, в новгородских и владимирских землях. Фамилия недворянская, массовая: её носили в основном крестьяне, мещане и духовенство. В среде священнослужителей фамилии часто давали по «говорящим» качествам — Незлобин мог получить её в семинарии за тихий нрав, хотя это скорее исключение: обычно семинарские фамилии образовывали от названий церковных праздников или греческих корней.

Ударение в фамилии плавающее: в центральных областях чаще говорят Незло́бина, а на юге и в Поволжье — Незлоби́на. Вариант с ударением на последний слог встречается реже и может указывать на украинское или белорусское происхождение, но для Незлобина это нехарактерно — фамилия почти исключительно великорусская.

Однокоренные фамилии — Незлобов, Незлобливый, Незлобьев — встречаются реже и обычно фиксируются в разных говорах. Например, форма Незлобов характерна для южнорусских областей, где использовали суффикс -ов, а не -ин. Носительница фамилии Незлобина может с высокой вероятностью предположить, что её предки жили в зоне московского или новгородского влияния и не принадлежали к высшему сословию.