Фамилия Ничипиенко — украинская по модели образования, характерная для тех регионов, где фамилии на -енко стали массовым явлением: Левобережье, Слобожанщина, южные земли. Суффикс -енко в украинской ономастике XVI–XVIII веков означал «сын такого-то», «потомок». В этом смысле Ничипиенко — «сын Ничипора».

Основа — разговорная форма канонического имени Никифор. В народном произношении оно дало несколько вариантов: Ничипор, Микипор, Никифор. Украинская традиция часто смягчала или переставляла звуки: «Ничипор» вместо «Никифор» — естественный результат живого произношения, где греческое Nikephoros (от nike — победа, phero — несу) превратилось в «победоносца», но в быту обросло местными чертами. Фамилия Ничипиенко — не единственная в этом ряду: Ничипоренко, Ничипоров, Никифоренко, Никифоров — все они восходят к одному имени, но различаются суффиксами и ареалом.

Интересная деталь: фамилия не встречается в центральных и западных областях Украины в большом количестве. Её основной ареал — Черниговская, Сумская, Полтавская области, а также юг России (Кубань, Ростовская область), куда переселенцы из Малороссии принесли свои фамилии в XIX веке. Это указывает на то, что предки носителя фамилии были либо казаками, либо крестьянами-однодворцами, осваивавшими новые земли.

С точки зрения словообразования: корень Ничип- + суффикс -иенк- (фонетический вариант -енко после мягкого согласного). Ударение в фамилии обычно падает на второй слог — Ничипие́нко, хотя в некоторых говорах смещается на третий. Вариант написания с двумя «и» (Ничипиенко, а не Ничипоренко) закрепился из-за того, что в основе лежит не полное имя Ничипор, а его усечённая форма Ничип — так в украинской традиции нередко образовывали фамилии от обиходных сокращений.

Социальный контекст: фамилии на -енко в XVIII–XIX веках были преимущественно крестьянскими и казачьими, реже — мещанскими. Дворянство такие формы почти не использовало. Поэтому предки Ничипиенко с высокой вероятностью были свободными сельскими жителями, а не крепостными, особенно если фамилия зафиксирована на Слобожанщине или Кубани.