Фамилия Ничогина женская, а её мужской вариант — Ничогин. Форма на -ин указывает на принадлежность: Ничогин значит «сын Ничоги» или «человек из семьи Ничоги». Основа здесь неочевидна, и это как раз тот случай, когда без диалектной лексики не разобраться.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Ничога. В русских говорах, особенно северных и уральских, «ничога» — человек, который ни к чему не годен, неспособный, неумелый. Слово образовано от «ничего» с характерным для народной речи стяжением: ничего → ничо → ничога. Такие прозвища давали не обязательно в обиду — часто с долей иронии или как бытовую характеристику. В крестьянской среде, где ценилась работящесть, «ничога» звучало как мягкое порицание, но могло закрепиться и за ребёнком, который родился слабым или болезненным.

Менее вероятная версия — связь с украинским или белорусским «нічога» в значении «ничего» или «ничуть». В таком случае прозвище могло означать человека, которому всё нипочём, безразличного. Но географически фамилия Ничогин встречается в основном в центральной России и на Урале, что склоняет к первой, севернорусской трактовке.

Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от слов женского рода или прозвищ на -а/-я. По сословной принадлежности Ничогины, скорее всего, крестьяне или мещане — фамилия не встречается в дворянских родословных книгах.

Фамилия редкая, однокоренные — Ничаев, Ничев, Ничков — имеют ту же смысловую основу «ничто», но разное морфологическое оформление. Ничогин выделяется на их фоне полногласной формой и диалектным оттенком.