Фамилия Нигмонов — редкая, и её происхождение напрямую связано с тюркскими языками. В основе лежит слово «нигман» или «ныгман». В татарском, башкирском и казахском языках «ныгман» (Niğman) — это имя арабского происхождения, означающее «благодать», «милость», «процветание». Таким образом, Нигмонов — это отчество от личного имени Нигман, то есть «сын Нигмана».

Модель образования типична для русской фамилии: к тюркской основе добавили русский патронимический суффикс -ов. Это говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, жил в среде, где было смешение русской и тюркской культур — в Поволжье, на Урале или в Западной Сибири, среди татар, башкир или казахов, которые принимали православие или тесно контактировали с русским населением.

Никакой другой, более древней славянской основы у фамилии нет. Вариант «Нигмон» как прозвище от русского слова маловероятен — в русских говорах такого корня не зафиксировано. Фамилия могла возникнуть и у крещёных татар, и у русских, взявших фамилию по крёстному отцу или соседу-тюрку.

Встречается фамилия крайне редко, в основном в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и мещанами или служилыми людьми — точных данных по династиям нет. В отличие от фамилий на -ин или -ский, Нигмонов не даёт подсказки о роде занятий, только об имени родоначальника.