Фамилия Никоаенко — один из тех редких случаев, когда написание искажено до неузнаваемости, но при этом почти не оставляет сомнений в своём происхождении. Скорее всего, перед нами опечатка или ошибка записи, закрепившаяся в документах. Исходная и самая вероятная форма — Николаенко. Буква «а» вместо «ла» возникла либо при неразборчивом почерке, либо при устной передаче фамилии переписчиком, который «проглотил» слог. Встречаются и единичные случаи бытования «Никоаенко» как самостоятельного варианта, но их крайне мало.

Если отбросить искажение, фамилия строится по классической украинской модели. Основа — каноническое имя Николай (от греч. «победитель народов»). Суффикс -енко — один из самых распространённых в украинской антропонимии. Изначально он означал «маленький», «сын» или «потомок». Таким образом, Николаенко — это «сын Николая» или «потомок человека по имени Николай». Фамилия закрепилась в среде крестьянства и казачества на территории современной Украины, особенно в её центральных и восточных областях.

Написание «Никоаенко» встречается в основном в метрических книгах XIX века и в советских паспортных записях, где ошибки при заполнении были обычным делом. Если вы носите именно этот вариант, ваши предки, скорее всего, были выходцами из украинских губерний, а сама фамилия — результат канцелярской случайности, которая со временем стала официальной.