Фамилия Нисенбойм ведет свое начало от двух немецких слов: nisten и bäumen. Первое из них в переводе на русский язык означает «гнездиться, жить, проживать», а второе - «закреплять жердью, увязывать», «становиться на дыбы», «упрямиться, противиться». Согласно этому, можно предположить, что родоначальник Нисенбойм мог жить в крепком, надежном доме или же он был своенравным человеком.