Фамилия Нивиртий — редкая и нестандартная для русского ономастикона. Её происхождение почти наверняка связано с искусственной книжной традицией, а не с народным прозвищем или географическим названием. В основе лежит латинское слово nives (родительный падеж nivis — «снег») или прилагательное niveus — «снежный, белоснежный». Форма «Нивиртий» выглядит как латинизированное прилагательное или существительное с суффиксом -ий, характерным для семинарских фамилий, которые давали выпускникам духовных училищ.

В XIX веке в духовных академиях и семинариях было принято переводить русские фамилии на латынь или греческий, а затем русифицировать окончание. Если предок носил фамилию Снегин, Снежков или Белов, её могли «возвысить» до Нивиртия — от латинского «niveus». Суффикс -ий (вместо ожидаемого -ий) указывает на грецизированное оформление, что тоже типично для семинарской среды: так создавали фамилии вроде Касторский (от лат. castor — бобр) или Альбов (от albus — белый). Нивиртий — аналог фамилии Снежницкий или Белявский, но с явным книжным, «учёным» оттенком.

География фамилии крайне узкая. В дореволюционных метрических книгах и адрес-календарях Нивиртий встречается почти исключительно среди лиц духовного звания — священников, дьяконов, псаломщиков. Встречаемость единичная, в основном на территории центральных губерний (Тверская, Ярославская, Московская). Никакой иной — тюркской, финно-угорской или балтийской — версии происхождения эта фамилия не имеет: звуковой облик и словообразовательная модель однозначно указывают на латинский корень.

Носители фамилии Нивиртий — почти наверняка потомки выпускников духовных семинарий, получивших фамилию при поступлении или окончании. Социальный контекст ясен: это не крестьянский и не купеческий род, а среда церковнослужителей, где ценилось знание классических языков. В советское время фамилия могла смениться или исчезнуть из-за репрессий или смены паспортных данных, поэтому сегодня она встречается редко и часто вызывает удивление даже у специалистов-ономастов.