Фамилия Низохин — редкая и неочевидная для быстрого толкования. В ней слышится что-то «низкое», но прямой путь от прилагательного «низкий» здесь не работает: суффикс -ох- в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на прозвище, образованное не от качественного прилагательного, а от глагольной или звукоподражательной основы.

Самая вероятная версия — связь с диалектным глаголом «низохать» или «низать». В северных и сибирских говорах «низохать» означало «бродить без дела», «слоняться», «шататься». Человек, который «низохает», — непоседа, бродяга, праздный гуляка. От такого прозвища Низоха и возникла фамилия Низохин: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?») — сын Низохи. Модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я.

Менее убедительна связь с основой «низ» в значении «низкий ростом» или «низкого происхождения». Если бы прозвище было Низок или Низкий, фамилия звучала бы как Низков или Низкин. Суффикс -ох- здесь лишний, и без диалектного глагола его появление не объяснить. Поэтому версия с «низохать» выглядит правдоподобнее.

Географически фамилия Низохин тяготеет к северным областям России — Архангельской, Вологодской, а также к Сибири, куда уходили переселенцы. В дореволюционных метрических книгах она встречается в основном среди крестьян и мещан. Сословной привилегированности за ней не зафиксировано: это фамилия простого люда, прозвищная, бытовая.

В написании возможна путаница с фамилией Нозохин (от «ноздря»), но это разные корни. Низохин — редкий случай, когда прозвище сохранило глагольную динамику: предок, скорее всего, не был «низким», а был человеком, который «низохает» — ходит без цели, не сидит на месте.