Фамилия Нуфрученкова — женская форма фамилии Нуфрученков. Её основа, скорее всего, восходит к прозвищу или мирскому имени, которое образовано от редкого слова «нуфра» или «нуфрый». В русских говорах слово «нуфра» не зафиксировано в основных диалектных словарях, но существует версия, что это искажённая форма от «нутро» (внутренность, содержимое) или от «нутрить» (понимать, смекать). Если так, то прозвище Нуфра мог получить человек проницательный, «нутром» чующий суть вещей. Однако более вероятно, что корень связан с диалектным «нуфрый» — так в некоторых областях называли хмурого, недовольного или капризного человека. В этом случае фамилия Нуфрученков — это «сын Нуфрого» или «внук Нуфры».

Суффикс -ченков указывает на украинское или южнорусское происхождение. Это вариант патронимического суффикса -ченко (как в фамилиях Шевченко, Коваленко), к которому добавили русское окончание -ов. То есть исходная форма — Нуфрученко, а Нуфрученков — её обрусевший вариант. Такие фамилии массово возникали в XIX веке при переселении украинских крестьян на Дон, Кубань и в южные губернии России, где местные писаря переделывали «нетипичные» окончания на -ов, чтобы фамилия звучала привычнее.

География фамилии сегодня неширокая. По данным открытых источников, Нуфрученковы встречаются в Ростовской области, Краснодарском крае и на юге Украины. Это подтверждает версию о южнорусском происхождении. Единичные носители есть в Москве и Подмосковье — скорее всего, потомки тех, кто переехал в столицу в XX веке.

Сравнение с однокоренными фамилиями, такими как Нуфров, Нуфрин, Нуфриков, показывает, что основа «нуфр-» встречается редко. Это делает фамилию Нуфрученкова ценной для генеалогии: её носители, вероятно, происходят из одной небольшой локальной группы, где прозвище Нуфра было в ходу. В дореволюционных метрических книгах фамилия могла записываться как Нуфрученко, Нуфрученков или даже Нуфрученковъ — с твёрдым знаком на конце.