Фамилия Нунгесер — настолько редкая, что её носители, скорее всего, могут пересчитать друг друга по пальцам. В русском ономастиконе она не встречается, и это сразу подсказывает, что перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная или искусственно созданная. Скорее всего, она образована за пределами славянского ареала, и её корни стоит искать в тюркских, монгольских или кавказских языках.

Разложим фамилию на части. Основа «нунге» (или «нунга») может восходить к тюркскому слову «нун» — «день» или «солнце», а в некоторых диалектах — «свет». Вторая часть, «сер», — распространённый в тюркских языках суффикс, часто означающий «голова», «вершина» или «начальник» (ср. «баш» в турецком). Вместе «Нунгесер» могло быть прозвищем или титулом вроде «светлая голова» или «предводитель дня» — так могли назвать старейшину, вождя или человека, выделявшегося умом и авторитетом.

Есть и другая версия: если фамилия происходит из монгольского или бурятского круга, «нунге» могло быть искажённым «нудэн» (глаз) или «нуга» (луг, пастбище). Тогда «сер» — это уже не суффикс, а отдельный корень, означающий «жёлтый» или «светлый» в некоторых тюркских языках. В таком случае прозвище могло описывать внешность: «жёлтоглазый» или «человек со светлыми глазами». Это правдоподобно, если предки жили в степной зоне, где смешивались тюркские и монгольские племена.

Географически фамилия может указывать на регионы, где говорили на ногайском, карачаево-балкарском или кумыкском языках. Возможно, предки Нунгесеров были скотоводами или воинами, а само прозвище закрепилось за родом, который славился мудростью или внешним обликом. В русские фамилии она могла попасть через метрики или перепись, когда прозвище записали как есть, без типичных русских суффиксов -ов или -ин, — это бывает с поздними переселенцами.

Спорных версий здесь почти нет, потому что данных о фамилии крайне мало. Самая сильная гипотеза — тюркская, с основой «нун» (день) и суффиксом «сер» (голова). Если у вас есть семейные предания или точное место, откуда родом предки, это помогло бы уточнить — например, если они из Дагестана или Поволжья, версия с «нуга» (луг) становится менее вероятной.