Фамилия Нусипходжаев — верный признак того, что предки её носителя происходят из Средней Азии, скорее всего из Узбекистана или Таджикистана, с возможным ответвлением в казахскую или уйгурскую среду. Она сложена из двух частей, соединённых по тюркской модели и оформленных русским патронимическим суффиксом -ев.

Первая часть — Нусип. Это местный фонетический вариант арабского имени Юсуф (Иосиф). В тюркских языках, особенно в казахском и каракалпакском, начальное «й» часто переходит в «н» или отпадает, а гласные редуцируются: так Юсуп превращается в Нусип, Нуспа или Ысып. Вторая часть — ходжа (хожа, ходжи). В исламском мире ходжами называли потомков пророка Мухаммеда (сайидов), а также уважаемых купцов, крупных землевладельцев или духовных наставников. В Средней Азии слово «ходжа» стало сословным маркером: ходжи составляли привилегированную группу, не платившую налогов и занимавшую видное место в обществе.

Таким образом, Нусипходжа — это имя-композит, которое можно перевести как «Юсуф-ходжа» или «ходжа по имени Юсуф». Вероятно, его дали в честь деда или местного святого, чтобы подчеркнуть и личную набожность, и принадлежность к уважаемому роду. Суффикс -ев (вместо более ожидаемого -ов) здесь — чисто русская грамматическая добавка, возникшая при паспортизации: фамилии на согласный в советских ЗАГСах часто оформляли через -ев, если основа оканчивалась на мягкий или шипящий звук (в произношении «Нусипходжа» звучит с мягким «а» на конце).

По социальному происхождению носители фамилии Нусипходжаев — потомки не крестьян и не кочевников-скотоводов, а скорее городского духовенства или зажиточных торговцев. В XIX — начале XX века ходжи составляли заметную прослойку в таких городах, как Ташкент, Самарканд, Хива и Коканд. Фамилия сравнительно редкая: она не попала в массовые списки русских фамилий и почти не встречается за пределами Средней Азии и диаспор.

Особенность написания — двойной «х» в середине (Нусип-ходжа-ев) — сохраняет память о том, что это не просто одно слово, а склейка двух значимых частей. Если встретите вариант «Нусипходжаев», знайте: это та же фамилия, но записанная через дефис или с одним «х» — такие формы встречаются в документах начала XX века из-за нестабильной орфографии.