Фамилия Нышпора — редкая, с неочевидной этимологией, и чтобы её разобрать, придётся заглянуть сразу в несколько языковых углов. Первое, что бросается в глаза, — окончание -а. В русских фамилиях оно часто указывает на украинское, белорусское или польское происхождение, где форма на -а нормальна для мужских фамилий (в отличие от великорусской традиции, где такие фамилии обычно склоняются как женские). Сама основа Нышпор- не имеет прямых аналогов в славянских корнях, что наводит на мысль о заимствовании или переосмыслении.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с литовским или балтским субстратом. В литовском языке есть слово nišporas — так называют вид клёна, точнее, клён полевой (Acer campestre). Это дерево, распространённое в западных регионах бывшей Речи Посполитой. Фамилия могла возникнуть как прозвище человека, жившего у заметного клёна, либо как указание на место — деревню или урочище, где росло много таких деревьев. В пользу этой гипотезы говорит и то, что фамилии, образованные от названий растений, типичны для белорусско-литовского пограничья (сравните: Берёза, Кленович, Липа).

Вторая, менее очевидная версия — диалектное искажение фамилии от немецкого или еврейского корня. Например, фамилия Нишпор (Nischpor) могла возникнуть из идишского нишпо́р — «не пророк», то есть человек, который не угадывает, не предсказывает. В таком случае это могло быть ироническое прозвище. Однако форма Нышпора с ударением на первый слог (как чаще всего произносят) плохо вписывается в эту модель — в идише ударение обычно на последний слог.

Географически фамилия Нышпора встречается крайне редко, в основном на западе Беларуси и в приграничных районах Польши. Это подтверждает балтскую версию: ареал клёна полевого как раз совпадает с зоной исторического расселения ятвягов и литвинов. С точки зрения словообразования, суффикса в фамилии нет — это чистая основа, что характерно для прозвищных фамилий, которые не успели обрасти типичными русскими суффиксами -ов или -ин. Такие «голые» формы часто встречаются у шляхты и мещанства, где фамилия фиксировалась в документах без изменений.

Если предки носителя фамилии были крестьянами, то их прозвище могло быть связано с деревом — возможно, они жили в лесистой местности или занимались лесным промыслом. Если же речь о горожанах или ремесленниках, то вероятнее литовский или польский источник. Однозначно сказать сложно: фамилия настолько редкая, что не попала в основные ономастические словари, и любые выводы остаются реконструкцией.