Фамилия Нюбина — женская форма, а её мужской вариант — Нюбин. Это отчество второго порядка, образованное не напрямую от имени, а от прозвища или мирского имени Нюба. Сама по себе фамилия редкая и вызывает вопросы, потому что корень «нюб» неочевиден для современного уха.

Самый вероятный источник — диалектное слово «нюба» или «нюбый». В северных и сибирских говорах «нюбый» означало «вогнутый, выгнутый дугой», а также «сгорбленный, сутулый». Прозвище Нюба могли дать человеку с характерной осанкой — сгорбленному, ходившему согнувшись. Модель образования проста: прозвище Нюба плюс притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Нюбин сын, Нюбина дочь). Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от слов женского рода или от прозвищ на -а/-я.

Есть и менее распространённая версия — связь с глаголом «нюнить» (плакать, хныкать) или существительным «нюня» (плакса, разиня). В этом случае Нюба — сокращённая форма от Нюня, а фамилия указывала бы на особенность характера предка. Однако эта версия слабее: форма Нюба из Нюня маловероятна, обычно такие прозвища сохраняли полный корень (Нюнин).

Фамилия Нюбина встречается в основном на Русском Севере (Архангельская область) и в Поволжье — регионах, где диалектная лексика сохранялась дольше всего. В дореволюционных переписях носители фамилии — в основном крестьяне и мещане, что характерно для «прозвищных» фамилий, не связанных с духовенством или дворянством.

Таким образом, предки современных Нюбиных с высокой вероятностью получили фамилию от прозвища, данного за внешность или походку. Никакой связи с иностранными языками или знатным родом здесь нет — это чисто русская, народная фамилия, в основе которой лежит меткое бытовое слово.