Фамилия Нюкля — редкий случай, когда основа настолько неочевидна, что заставляет задуматься: перед нами искажённое заимствование, местное диалектное слово или результат канцелярской ошибки? Самое правдоподобное объяснение лежит в области финно-угорских языков, точнее — карельского или вепсского. В них есть основа nyk- со значением «дёргать, тянуть, тащить». От неё образовано слово nykylä — «тянучка», «нечто вязкое», а также прозвище для медлительного, тягучего человека или того, кто постоянно дёргается, суетится. Фамилия могла закрепиться за переселенцами с Русского Севера, особенно из Карелии или Архангельской области, где такие прозвища были в ходу.

Модель образования проста: прозвище Нюкля (человек, названный по характерному действию или качеству) перешло в фамилию без изменений. Суффикса -ов или -ин здесь нет — это так называемая «окаменевшая» форма, типичная для украинских, белорусских и севернорусских фамилий, где прозвище на -а/-я нередко становилось родовым именем. Сравните с фамилиями Кисля, Гниля, Ширя — все они образованы по тому же принципу.

Менее вероятная, но встречающаяся в любительской ономастике версия выводит Нюклю из диалектного глагола «нюкать» — мяукать, издавать жалобные звуки. В этом случае предок мог получить прозвище за плаксивый голос или привычку ныть. Однако у этой гипотезы слабая лексическая база: «нюкать» — слово редкое и не зафиксировано в основных говорах. Финно-угорский след выглядит убедительнее, тем более что на северо-западе России фамилии с основой на -кл- встречаются именно в зоне контакта с прибалтийско-финскими языками.

География фамилии узкая. Носители Нюкли встречаются в основном в Ленинградской, Вологодской областях и в Карелии — то есть там, где исторически жили вепсы и карелы. В центральных и южных регионах России фамилия практически не фиксируется. Это косвенно подтверждает версию о финно-угорском корне: фамилия осталась локальной, не разошлась по всей стране.

Сословная принадлежность предков, скорее всего, крестьянская. Никаких дворянских родов Нюкля не известно, в купеческих гильдиях она тоже не отмечена. Зато в метрических книгах XIX века можно найти записи о крестьянах и мещанах с такой фамилией в Олонецкой и Петербургской губерниях.