Фамилия Охтенский звучит как прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?» или «откуда?», и её происхождение напрямую связано с географическим названием. В основе лежит топоним Охта — это река в Ленинградской области, впадающая в Неву, и исторический район на её берегах в Санкт-Петербурге. Суффикс -ск- указывает на принадлежность к местности: Охтенский буквально означает «с Охты», «выходец с Охты» или «относящийся к Охте». Это типичная модель для фамилий, образованных от названий рек, городов или урочищ (сравните: Волжский, Загорский, Смоленский).

Фамилия эта — не древняя крестьянская, а, скорее всего, более поздняя, искусственная или семинарская. В Российской империи фамилии на -ский/-цкий часто давали выпускникам духовных училищ и семинарий, особенно если их мирская фамилия казалась неблагозвучной. Священник или ученик, родом из местности у реки Охты, мог получить фамилию Охтенский при поступлении в семинарию. Второй возможный путь — её могли присвоить выходцам из Охтинских слобод, где жили работники пороховых заводов и адмиралтейские мастеровые. В XVIII–XIX веках Охта была не парадным центром, а рабочим предместьем, и фамилия могла закрепиться за потомками этих мастеровых.

Менее вероятна, но не исключена связь с финно-угорским словом «охо» (медведь) или с диалектным «охтать» (кричать, аукать). Однако приоритет остаётся за рекой Охтой — топоним зафиксирован в писцовых книгах XV века, а фамилия Охтенский встречается в метрических книгах Петербургской губернии уже в XIX веке. Носители её — люди, чьи предки жили на севере столицы, на берегах Охты, и либо служили при храмах, либо работали на промышленных окраинах.

Орфографическая особенность: в дореволюционных записях фамилию могли писать через «е» — Охтенскій, реже Охтинский (от старого названия Охтинские слободы). Современное написание с «е» в корне закрепилось за счёт литературной нормы «охтенский» (житель Охты). Это редкая фамилия, не входящая в сотни самых распространённых, но хорошо узнаваемая для петербуржцев и краеведов.