Фамилия Оматаев — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а тюркская, и разбор её требует обращения к восточным именам и прозвищам. Суффикс -ев указывает на русскую модель патронимического образования, но корень «Омат» выводит нас в мир мусульманских имён и названий.

Самая вероятная версия — происхождение от имени Омат, которое является диалектной или фонетической формой арабского имени Ахмад (один из эпитетов пророка Мухаммеда, означающий «достохвальный», «самый восхваляемый»). В тюркских языках, особенно у народов Поволжья и Кавказа, звук «х» часто редуцировался или переходил в «ъ», а в устной речи имя могло упроститься до Омат. Таким образом, Оматаев буквально означает «потомок Омата (Ахмада)». Это типичная модель для фамилий, возникших в среде татар, башкир, кумыков или ногайцев, которые после вхождения в состав Российской империи получали фамилии по отцу с русским суффиксом.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с арабским словом «умата» (община, народ) или с топонимом Омат (название селения или реки). Однако в таком случае фамилия скорее звучала бы как Оматов или Оматский. Форма на -аев характерна именно для имён, оканчивающихся на согласный или «а», поэтому версия с личным именем выглядит убедительнее.

Географически фамилия Оматаев тяготеет к регионам с тюркским населением: Дагестан, Чечня, Астраханская область, Татарстан. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении — возможно, от конкретного рода или аула. Сословно предки Оматаевых скорее всего были крестьянами или казаками, но не исключено и духовное звание, если имя восходит к уважаемому религиозному деятелю.

В написании фамилии стоит обратить внимание на вариант Оматаев (с буквой «о») — он закрепился в русской записи, хотя в оригинале имя могло произноситься с твёрдым приступом, близким к «а». Это типичный пример адаптации восточного имени к русской графике, где не было буквы для обозначения краткого «ъ» или специфического гортанного звука.