Фамилия Омшенецкий — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять корень, нужно отбросить суффикс -ецк- (вариант -ск- с наращением, типичный для польских, украинских и западнорусских фамилий, указывающий на принадлежность к месту) и окончание -ий. Основа — Омшен-. Самая правдоподобная версия ведёт к слову «омшеник»: так в архангельских, вологодских и сибирских говорах называли моховую подстилку в стене или крыше, а также утеплённый мохом амбар или клеть. В переносном смысле «омшеником» могли прозвать плотника, который конопатил и утеплял строения, или хозяина, державшего добротный, «моховой» амбар. То есть Омшенецкий — это, скорее всего, потомок человека, которого в округе знали как Омшеника (от слова «омшеник»), а после переселения в другую местность его дети стали писаться как «выходцы из села Омшеники» или «те, кто от Омшеника» — Омшенецкие.

Географическая привязка фамилии тоже работает. На карте современной Беларуси, в Витебской области, есть деревня Омшенец (также встречается написание Омшенец или Омшанец). Такие топонимы обычно происходят от того же «омшеника» — утеплённого строения или места, где заготавливали мох. Носитель фамилии мог получить её по названию родового гнезда: «Омшенецкий» — тот, кто родом из Омшенца. Суффикс -ецк- здесь работает как классический указатель на географическое происхождение, в отличие от простого -ск-, который чаще прибавляется к названиям на -ино/-ово.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что модель нестандартна. В русской среде от того же «омшеника» чаще образовывали фамилии на -ов и -ин: Омшаников, Омшеников. Форма на -ецкий — явный признак западнорусского или польско-литовского влияния, где прилагательные на -ский были доминирующей моделью для шляхты и мещан. Это не говорит о дворянском происхождении каждого Омшенецкого, но указывает на регион, где фамилия оформилась — скорее всего, на территории бывшего Великого княжества Литовского (современные Беларусь, Смоленщина, Украина). Спорные версии, связывающие фамилию с личным именем Омшан (гипотетическая форма от Емельян или Онисим), маловероятны: для таких имён есть более прямые пути (Омельченко, Онисимов), а «омшеник» даёт более конкретный и бытовой след.

По сословному составу Омшенецкие, судя по разрозненным архивным записям XIX века, встречались среди крестьян и однодворцев западных губерний, а также среди мещан. Фамилия осталась редкой: она не размножилась за счёт массового крестьянского прозвища, а закрепилась в локальной точке — либо в конкретном селе, либо в одной-двух семьях, которые её и разнесли.