Фамилия Онанидзе звучит для русского уха необычно, но её происхождение прозрачно для того, кто знаком с грузинской антропонимией. Это типичная грузинская фамилия, образованная по одной из самых распространённых моделей: с помощью патронимического суффикса -дзе. В переводе с грузинского -дзе означает «сын», то есть Онанидзе буквально — «сын Онана».

Корень фамилии — личное имя Онана. В Грузии это имя имеет древние корни и является формой библейского имени Онан, которое пришло вместе с христианством. Ветхозаветный Онан — персонаж, чьё имя стало нарицательным, но в Грузии оно воспринималось как обычное календарное имя, без негативного подтекста. Со временем имя Онана, как и многие другие библейские имена, потеряло прямую связь с первоисточником и стало просто традиционным мужским именем, от которого и пошла фамилия.

Географически фамилия Онанидзе чаще всего встречается в западных регионах Грузии, особенно в Имеретии и Гурии. Именно для этих областей характерна модель фамилий на -дзе (в отличие от восточной Грузии, где распространён суффикс -швили). Это указывает на то, что род, носящий эту фамилию, имеет корни в западногрузинской исторической области.

Поскольку фамилия образована от личного имени, а не от прозвища или профессии, её носители могли принадлежать к разным сословиям. В Грузии фамилии на -дзе носили как князья, так и крестьяне. Различия в социальном статусе внутри одной модели часто определялись не суффиксом, а известностью рода и историческими документами. Прямых свидетельств о принадлежности Онанидзе к аристократии нет, поэтому вероятнее всего, это рядовая крестьянская или городская фамилия, возникшая в среде простых людей.

В русском языке фамилия Онанидзе, как и большинство грузинских фамилий, склоняется по правилам заимствованных слов: в мужском роде (Иван Онанидзе, Ивана Онанидзе), а в женском — нет (Анна Онанидзе). Несмотря на созвучие корня с медицинским или бранным термином, этимологически фамилия восходит исключительно к библейскому имени и не имеет никакого отношения к поздним заимствованиям из латыни.