Фамилия Онищишин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Онищишин послужило имя Онищиша. Имя Онищиша является производной формой крестильных мужских имен Иоаникий (в переводе с греческого «непобедимый»), Онисим («полезный»), Анисий («исполнение, завершение»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Онищиша, со временем получил фамилию Онищишин. О точном месте и времени возникновения фамилии Онищишин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Онищишин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.