Фамилия Онищишин отвечает на вопрос «чей ты?» и указывает на прямого предка по мужской линии: того, кого в быту звали Онищиша. Это не полное церковное имя, а его обиходная, уменьшительная форма, типичная для украинских и южнорусских говоров, где суффикс «-ища» придавал имени оттенок ласковости или, наоборот, фамильярности. Привычное для нас окончание «-ин» в данном случае не означает принадлежность матери, как в фамилиях типа Марьин или Татьянин, а работает как притяжательный суффикс: Онищишин — это сын, внук или потомок Онищиши.

Корень у этого прозвища неоднозначный, и здесь есть простор для версий. Самая вероятная связь — с крестильным именем Иоаникий, которое в греческом языке означает «непобедимый». В народной речи имя Иоаникий часто сокращали и переделывали до неузнаваемости, и форма Онищиша вполне могла возникнуть именно из него. Однако нельзя исключать и смешения с другими именами. Например, с Онисимом («полезный») или Анисием («исполнение, завершение»), которые звучат похоже и также давали жизнь уменьшительным формам. В живой речи границы между этими именами стирались, поэтому для фамилии Онищишин точный первоисточник не так важен, как сам факт: в основе лежит популярное в прошлом личное имя, которое сегодня почти вышло из употребления.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Онищишин стоит в одном ряду с Онищенко, Онищук, Онисимов и Оничкин. Географически фамилия тяготеет к западноукраинским землям, особенно к Тернопольской, Ивано-Франковской и Львовской областям, где суффикс «-ишин» был распространённым способом называть потомков. Такая модель чаще встречалась в сёлах, где фамилии закреплялись позже, чем в городах, и отражали не сословие, а конкретное семейное прозвище.

Сам носитель имени Онищиша, скорее всего, не был выдающимся человеком — ни князем, ни военачальником. Это был обычный крестьянин, ремесленник или казак, которого так звали соседи и родня. Но именно его личное имя, пережив века, стало родовым знаком для целой семьи. Сегодня фамилия Онищишин остаётся довольно редкой, и её носители, как правило, хорошо помнят о своих украинских корнях, даже если сами живут далеко от исторической родины.