Фамилия Онжулис — редкая и нестандартная для русского слуха. Её происхождение почти наверняка не славянское, а прибалтийское, точнее — латышское или литовское. Об этом говорит окончание -ис, характерное для мужских фамилий в Латвии (ср. Берзиньш, Озолиньш, Калныньш). В литовском языке аналогичную роль играет суффикс -ис, но там фамилии чаще оканчиваются на -ас, -ис, -ус. Таким образом, Онжулис — это фамилия, которая прошла русификацию через добавление русского окончания -ов или осталась в исходной прибалтийской форме, но бытует в русскоязычной среде.

Основа фамилии — Онжул- — может восходить к личному имени или прозвищу. Наиболее вероятная версия: это вариант латышского имени Anžs (Анж) или литовского Ansas, которые являются краткими формами от имени Иоанн (Янис, Йонас). В таком случае Онжулис — это патроним, то есть «сын Онжула» или «потомок Онжула». Менее вероятна связь с латышским словом «onža» (в значении «дядя»), но в ономастике такая модель встречается реже.

Фамилия не фиксируется в классических русских словарях фамилий (Унбегаун, Никонов), что подтверждает её инородное происхождение. Географически её стоит искать в западных регионах Российской империи — в Курляндской, Лифляндской или Ковенской губерниях, где жили латыши и литовцы. После переселения в центральную Россию или Сибирь фамилия могла сохранить исходное написание, не изменившись на Онжулов, что и делает её такой необычной.

Сословно носители фамилии Онжулис, скорее всего, были крестьянами или мещанами. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не значится. Сегодня она встречается единично, в основном на постсоветском пространстве, и почти всегда указывает на латышские или литовские корни предков.