Фамилия Ошомкова — женская форма фамилии Ошомков, и её происхождение ведёт к прозвищу или мирскому имени Ошомок. В основе лежит диалектное слово «ошомок» — так в некоторых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, называли обломок, щепку, отщеп, осколок или небольшой кусок чего-либо, отколотый от целого. Слово образовано от глагола «ошомнуть» (отломить, отколоть) с суффиксом -ок, характерным для обозначения предмета как результата действия.

Прозвище Ошомок могли дать человеку невысокого роста, щуплому телосложению, либо, в переносном смысле, тому, кто «откололся» от семьи или общины — бобылю, одинокому, отщепенцу. Встречается и другая версия: в некоторых регионах «ошомком» называли зазубрину на инструменте или заусенец, и прозвище могло относиться к человеку с резким, «колючим» характером. Суффикс -ов в мужской форме указывает на принадлежность: Ошомков — сын Ошомка, то есть потомок человека с таким прозвищем.

Фамилия редкая, географически привязана в основном к северным и вологодским землям, где диалектное слово было в ходу. В документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьян и посадских людей с этой фамилией в Вологодском и Архангельском уездах. Стоит отличать Ошомковых от похожих по звучанию Ошурковых (от ошурок — остаток, огрызок) — корни разные, хотя смысловая близость «обломка» прослеживается.

Модель образования типична для русских фамилий: прозвище на -ок (ср. Пушок, Сычок) плюс патронимический суффикс -ов. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Ошо́мкова, хотя в диалектной речи возможно смещение.