Фамилия Отхонова образована от мужского имени Отхон, а оно, в свою очередь, восходит к монгольскому или бурятскому слову «отхон» (младший, последний ребенок в семье). В традиционной культуре многих народов Центральной Азии младшему сыну нередко давали такое прозвище или имя, которое затем закреплялось за его потомками. Таким образом, основа фамилии — не прозвище по занятию или черте характера, а прямое указание на порядок рождения предка.

Суффикс -ов-/-ев- в фамилии — типичный русский патронимический формант, который присоединялся к иноязычным основам при адаптации фамилий в русской среде. В данном случае к основе Отхон- добавили -ов-, а затем женская форма получила окончание -а. Фамилия Отхонова — это «дочь (или жена) Отхона». Мужской вариант — Отхонов.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически сильны монгольские и бурятские корни: Бурятия, Забайкалье, Иркутская область. Встречается она и у калмыков, у которых слово «отхон» также означает «младший». В русском ономастиконе это редкая фамилия, нечасто встречающаяся за пределами этих территорий.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий, образованных от порядковых обозначений (Первов, Третьяков), Отхонова не имеет точного аналога в славянской традиции. В русском языке нет однословного обозначения «младшего ребенка» — это значение передавалось описательно. Поэтому фамилия Отхонова — яркий пример того, как иноязычная модель именования (по старшинству в семье) была перенесена в русскую фамильную систему через суффиксацию.

Если искать параллели, то однокоренными можно считать фамилии Отхонов, Отхонский, а также более редкие формы с суффиксом -ин (Отхонин). Все они имеют одну и ту же основу и схожую историю происхождения.