Фамилия Оттопкин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, не столько описывает человека, сколько называет его действие или состояние. Скорее всего, она образована от глагола «оттопырить» или «оттоптать» через просторечную форму «оттопка». Первое, что приходит на ум: «оттопыренный» — так могли прозвать человека с оттопыренными ушами, локтями или, в переносном смысле, заносчивого. Второе значение — «оттоптать», то есть примять, повредить ногами. Здесь прозвище Оттопок мог получить тот, кто ходил неуклюже, тяжело ступал, или же крестьянин, который нечаянно оттоптал соседу ногу.

Модель образования проста: основа «оттопк-» (с чередованием к/ч в глаголе) плюс типичный русский суффикс притяжательности -ин, указывающий на принадлежность «сын Оттопка». Это характерно для фамилий, которые сложились в XVI–XVII веках в среде крестьян и посадских людей. Аналогичные фамилии — Оттопков, Оттопырев, Топтыгин — показывают, что корень был вполне употребителен в народной речи, хотя сегодня почти исчез.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) прямого упоминания Оттопкина нет, но модель с суффиксом -ин для прозвищ на -ка — одна из самых распространённых. Географически фамилия встречается редко, чаще всего в центральных и северных областях России. Возможно, в некоторых говорах «оттопок» означало также «обрубок», «огрызок» — тогда прозвище могло относиться к невысокому или коренастому человеку.

Версия о связи с топонимом (названием места) маловероятна: нет известных сел или рек Оттопка. Поэтому основная гипотеза — бытовое прозвище по внешности или поведению. Фамилия не дворянская и не купеческая; её носители — выходцы из простонародья, вероятно, крестьяне или ремесленники.