Фамилия Пачаджи — одна из тех, что сразу выдают не русское, а южное, скорее всего греческое или тюркское происхождение, пришедшее в Россию через Причерноморье. Корень здесь — «пача» или «паша», что в османском и греческом контексте означает не просто титул, а конкретную должность: наместника, военачальника или влиятельного чиновника. Суффикс «-джи» (в оригинале -ci или -τζής) — типичный тюркский словообразовательный элемент, обозначающий профессию или род занятий, как в словах «кебабджи» (повар кебаба) или «чалгыджи» (коса́рь). Таким образом, Пачаджи буквально значит «тот, кто служит паше» или «человек паши» — приближённый, управляющий, возможно, сборщик податей или начальник стражи.

В Российской империи фамилия была особенно распространена среди греков-понтийцев и малоазийских греков, переселившихся в Крым, Приазовье и на Кавказ в XIX — начале XX века. Многие из них занимались торговлей, ремёслами или служили в администрации. В отличие от типичных русских фамилий, оканчивающихся на -ов или -ин, Пачаджи не склоняется по падежам и сохраняет иноязычную форму — это маркер позднего вхождения в русский ономастикон.

Стоит различать два возможных прочтения. Если основа «паша» — османский титул, то фамилия указывает на служебное положение предка. Если же восходить к греческому πάππας (папас — «священник»), то вариант «Пападжи» был бы логичнее, но написание через «ч» закрепляет именно тюркский след. Встречается вариант Пачаджиев, где русский суффикс -ев пытается адаптировать фамилию, но оригинальная форма без окончания более архаична и точна.

Географически фамилия сегодня встречается в России (Ростовская область, Краснодарский край), на Украине (Одесса, Мариуполь) и в Греции. Из-за малочисленности носителей и отсутствия массовой миграции в советское время фамилия осталась редкой — её не встретишь в списках дворянства или купечества, зато можно найти в метрических книгах греческих церквей Крыма и Таганрога конца XIX века.