Фамилия Паканещикова — женская форма фамилии Паканещиков. Она образована по типичной русской модели: к основе мужской фамилии на -ов добавили окончание -а. Разбирать её стоит с мужского варианта, который встречается гораздо чаще и хранит ключ к происхождению.

Основа фамилии — «паканещик». Это слово, скорее всего, профессиональное прозвище. Скорее всего, перед нами вариант слова «паканечник» или «поканечник» — так в некоторых северных и сибирских говорах называли человека, который занимался изготовлением или продажей паканчиков. Паканчик — это небольшой кожаный кошель или кисет для табака и денег (слово «пакань» в архангельских говорах означала кожу). Значит, родоначальник Паканещиковых мог быть кожевником, шорником или мелким торговцем кожаными изделиями.

Суффикс -щик (в старом написании -щик, звучит как -щик) указывает на род деятельности. Это очень продуктивная модель для русских фамилий: бондарь — Бондарщиков, переплётчик — Переплётчиков. В данном случае суффикс присоединили к основе «пакан» (с переходом н/щ: пакан → паканещик). Фамилия редкая, географически привязана к Русскому Северу и, возможно, к Уралу — именно там бытовало слово «пакань» и его производные.

Других версий, например, от имени или прозвища Паканя (уменьшительное от Пахом или Панкрат), мало. Во-первых, тогда фамилия звучала бы как Паканин или Паканкин, а не Паканещиков. Во-вторых, суффикс -щик в основе — слишком сильный маркер профессии. Поэтому версия с ремеслом — основная и самая правдоподобная.

Таким образом, Паканещиков — это «сын паканещика», то есть человека, который шил или продавал кожаные кошельки. Фамилия сохранила в себе редкое диалектное слово, которое уже почти вышло из живого употребления, но продолжает жить в фамилии.