Фамилия Палафиров — редкий случай, когда самое интересное кроется не в корне, а в суффиксе. Если бы она звучала как Палафир, мы бы имели дело с прозвищем или неканоническим именем. Но суффикс -ов однозначно указывает на отчество: Палафиров — это «сын Палафира». Вопрос в том, откуда взялось само имя Палафир.

Скорее всего, это не славянское, а греческое имя, попавшее в русский язык через церковные книги. Вероятная основа — греческое имя Палафий (Palathios), которое в народном произношении могло дать форму Палафир. Второй вариант, более редкий, — переосмысление имени Паламон (Palamon) с добавлением звука «ф», что иногда случалось при заимствовании: Паламон → Палафон → Палафир. Оба имени встречаются в святцах, хотя и не часто.

География фамилии подсказывает, что это не случайный привозной вариант. Палафировы встречаются в старых документах по южнорусским и украинским землям — там, где греческое влияние через Киевскую духовную академию и южнославянские книги было сильнее. Это могла быть фамилия человека из семьи церковнослужителя или крестьянина, получившего имя по святцам, что в XVIII–XIX веках было нормой.

Есть и более прозаичная версия: Палафир могло быть прозвищем от диалектного слова. В некоторых говорах «палафир» или «палафирить» означало пустомелю, болтуна, человека, который говорит не по делу. Если это так, то фамилия — из прозвища, данного за характер. Но эта версия слабее: слово не зафиксировано в авторитетных словарях русских говоров, а греческая основа подтверждается аналогиями (сравните фамилию Паламарь, от греческого «пономарь»).

Итог: Палафиров — отчество от редкого крестильного имени Палафир. Предки носителя фамилии, скорее всего, жили на юге России или Украины и принадлежали к среде, где церковные имена давали по полному греческому списку, а не по ходовому календарю. Фамилия недворянская, но и не крестьянская в узком смысле — типичная для мещан, священников или однодворцев.