Фамилия Паломожных — редкий пример русской фамилии, образованной по модели родительного падежа множественного числа (суффикс -ых). Такая форма типична для северных и сибирских говоров, где отвечала на вопрос «чьи будете?» и указывала на главу семьи: Паломожных — буквально «из семьи Паломожного». В центральной России закрепилась бы форма Паломожнов, а здесь, на севере, сохранился архаичный тип.

Основа фамилии — прозвище Паломожный. В народной речи оно возникло как переделка книжного слова «паломник»: так называли странников-богомольцев, ходивших на поклонение святым мощам и приносивших оттуда на родину ветку пальмы (отсюда и корень). Не исключено, что основатель рода был глубоко верующим человеком и регулярно совершал паломничество в Иерусалим — такие путешествия в допетровской Руси были подвигом благочестия, и человека, совершившего их, окружающие выделяли уважительным прозвищем.

Но у слова «паломник» было и второе, менее известное значение — так в старину называли описания хождений к святым местам, своего рода путевые заметки. Поэтому правдоподобна и другая версия: прозвище Паломожный мог получить грамотный человек, который вёл записи, связанные с паломничеством, или переписывал такие хождения для монастырей и церквей. В условиях, когда книга была редкостью, а паломническая литература пользовалась спросом, такой труд давал человеку заметный статус в общине.

Обе версии сходятся в одном: прозвище указывает на связь с церковной традицией и странничеством. Какая из них ближе к истине, сказать трудно — письменных источников по такой редкой фамилии сохранилось мало. Но в любом случае потомок человека с прозвищем Паломожный, живший скорее всего в северных землях, со временем получил фамилию Паломожных, и она закрепилась за родом.