Фамилия Паниматченко — характерный пример восточноукраинской модели фамилий на -енко, самой распространённой на Левобережной Украине и в южных регионах. Суффикс -енко в XVII–XVIII веках означал «сын» или «потомок», то есть исходно фамилия передавала отчество: «Паниматченко» — сын Паниматки.

Основа фамилии — прозвище или имя Паниматка. Это, в свою очередь, уменьшительно-ласкательная форма от прозвища Паниматко, которое образовано от глагола «панимать» — диалектного варианта «понимать». В украинских говорах «панимать» могло иметь несколько значений: «понимать», «постигать», но также «брать», «хватать». Скорее всего, прозвище Паниматко дали человеку сметливому, сообразительному, который быстро схватывал суть дела. Возможен и иронический оттенок — так могли назвать того, кто делал вид, что понимает, или, наоборот, отличался чрезмерной понятливостью.

Фамилия редкая и географически привязана к Полтавщине и соседним областям. В метрических книгах XIX века Паниматченки встречаются в основном в Золотоношском и Пирятинском уездах — бывшей Полтавской губернии. Это подтверждает типично украинский ареал фамилии: она не перешла в русскую форму на -ов, а сохранила исходный суффикс.

Интересно, что в отличие от более частых фамилий на -енко (Пономаренко, Коваленко), Паниматченко образована не от профессии, а от личной характеристики. Это делает её более индивидуализированной: предок получил прозвище не по ремеслу, а по уму или манере поведения. Встречаются варианты написания — Пониматченко, Паниматченко, — но исходная форма с «а» отражает украинское аканье в разговорной речи.

Сословно носители фамилии относились к казачеству и государственным крестьянам. Дворянских корней у Паниматченко нет — это фамилия сельских жителей, что типично для большинства украинских фамилий на -енко.