Фамилия Панюгова — женская форма от Панюгов, и её разбор стоит начать с неочевидного: с суффикса. Модель на -ов/-ев здесь указывает на происхождение от прозвища или имени, которое заканчивалось на согласный. Но основа «Панюг» звучит нестандартно для русского уха. В ней слышен либо диалектный говор, либо иноязычный след.

Самая вероятная версия — связь с каноническим именем Панкратий, которое в народной речи сокращали до Паня, Панюха, Панюта. Суффикс -юг- — редкая, но встречающаяся в русских говорах модель: так образовывали прозвища от личных имён или черт характера (сравните: Витюг от Витя, Костюг от Костя). Панюг — это грубоватое, простонародное производное от Паня, то есть Панкратия. Фамилия Панюгов, а затем и Панюгова, закрепилась за потомками человека, которого в быту звали Панюгом.

Менее убедительная, но возможная версия — от географического названия. На карте России встречаются топонимы Панюги (например, в Кировской области). Тогда Панюгов — выходец из такого места. Однако для фамилии, образованной от названия села, чаще используют суффикс -ский (Панюжский), а -ов — типично для «именных» фамилий.

Сословной привязки у Панюговых нет: фамилия могла возникнуть и у крестьянина, и у посадского человека. В документах XVIII–XIX веков её носители встречаются в центральных и северных губерниях России — в Вологодской, Костромской, Вятской. Это косвенно подтверждает севернорусское происхождение модели с суффиксом -юг. В современной России Панюговы — фамилия редкая, но не исчезнувшая.