Фамилия Пасешников образована от прозвища или профессионального названия пасечник — пчеловод, содержатель пасеки. Основа здесь прозрачна, но интерес представляет суффиксальная цепочка, по которой фамилию можно отличить от более распространённых «пчеловодческих» фамилий.

В русской ономастике фамилии на -ников обычно указывают на профессию или занятие отца: пасечник → Пасечников. Но в данном случае мы видим форму Пасешников — с суффиксом -шник вместо -чник. Это не ошибка, а диалектная или разговорная черта: в южнорусских и некоторых центральных говорах звук «ч» перед «н» мог переходить в «ш» (ср. «скворешник» вместо «скворечник», «булошная» вместо «булочная»). Таким образом, Пасешников — это фонетический вариант фамилии Пасечников, закрепившийся в письменных источниках.

Корень слова — пасека, место, где стоят ульи. В свою очередь, пасека происходит от «сечь, высекать»: так называли участок леса, расчищенный под пасеку. Первые носители фамилии — скорее всего, крестьяне или ремесленники, занимавшиеся бортничеством или пасечным пчеловодством, которое на Руси было распространённым промыслом, особенно в лесных районах центра и юга.

Фамилия не относится к числу очень частых, но встречается в разных регионах, преимущественно в областях, где было развито пчеловодство: Воронежской, Курской, Рязанской. Встречается также написание Пасешников с одним «с» (Пасешников), что может быть следствием упрощения в документах или ошибок переписчиков.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования (от названий профессий с диалектным суффиксом) рассматриваются как характерные для народной, нелитературной традиции. Таким образом, фамилия Пасешников — живой след того, как местное произношение и реальное занятие предков закрепились в родовом имени.