Фамилия Павдеева — это женская форма, мужской вариант — Павдеев. Она образована по самой распространённой в русском языке модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основе, оканчивающейся на мягкий согласный. В данном случае основа — Павдей. Это имя или прозвище, которое, в свою очередь, является фонетическим вариантом канонического имени Павдий.

Имя Павдий (церковное, латинского происхождения) восходит к римскому родовому имени Paulus, что значит «маленький», «скромный». В русской народной среде такие имена часто упрощались и получали бытовые формы: Павдей, Павдейка. Суффикс -ей в данном случае мог быть не только уменьшительным, но и указывать на разговорное, обиходное произношение — так крестильное имя адаптировалось к живой речи.

С точки зрения социальной истории, фамилия Павдеев (и Павдеева) скорее всего принадлежала к среде крестьян или посадских людей. В центральных и северных губерниях России фамилии на -ев от полных и производных форм крестильных имён встречались повсеместно, но именно вариант с корнем «Павд-» — редкий. Он не попал в массовые списки распространённых фамилий, что говорит о локальном бытовании: возможно, родоначальник жил в одной волости или уезде, и фамилия не разошлась широко.

Учитывая редкость основы, стоит рассмотреть и альтернативную версию: Павдей могло быть не именем, а прозвищем, образованным от диалектного слова. В некоторых говорах «павда» означало «польза», «выгода» (ср. «павда» в значении «корысть»). Тогда прозвище Павдей мог получить человек расчётливый или удачливый в делах. Однако эта версия менее убедительна, так как в документах XVI–XVII веков имя Павдей встречается чаще, чем прозвище с таким корнем.

Таким образом, фамилия Павдеева — это отчество в форме притяжательного прилагательного: «чей сын?» — Павдеев, то есть потомок человека по имени Павдей. Носительница фамилии может считать себя наследницей рода, корни которого уходят в дофамильную эпоху, когда личное имя было единственным идентификатором, а позже закрепилось за семьёй в виде фамильного знака.