Павдюрин — фамилия с прозрачной основой, но неочевидной историей. В ней отчётливо слышится имя Павел, но не напрямую, а через редкую уменьшительную форму Павдя. Такое сокращение встречается в южнорусских и украинских говорах: Павдя, Павдюня, Павдюха. Суффикс -юрин в данном случае — вариант притяжательного суффикса -ин, характерный для фамилий, образованных от имён на -я или -юра. Павдюрин буквально значит «сын Павди» или «человек из рода Павди».

Корень здесь — не просто имя, а конкретное бытовое прозвище. В русской ономастике форма Павдя могла закрепиться за человеком небольшого роста или ребячливого нрава, но чаще всего это просто ласкательное обращение к Павлу, как Ваня или Петя. Интересно, что фамилия Павдюрин почти не встречается в центральных областях России — её ареал тяготеет к югу: Курская, Воронежская, Ростовская области, а также к украинским землям. Судя по переписям XIX века, Павдюрины были преимущественно крестьянами и однодворцами, то есть потомками служилых людей, осевших на южных рубежах.

Модель образования фамилии — типичная для русских отчеств на -ин, но с редким суффиксом -юрин. Это не ошибка письма и не вариант фамилии Павдюров (которая тоже существует, но от полной формы Павдюр). В словарях фамилия не фиксируется как распространённая, что говорит о её локальном бытовании. Если сравнивать с однокоренными — Павлов, Павлюков, Павлюченко — Павдюрин стоит особняком: в ней сохранилась нестандартная диалектная форма имени, которая в других регионах просто не прижилась.

Версия о нерусском происхождении фамилии (например, от тюркского или финно-угорского корня) маловероятна из-за очевидной связи с именем Павел. Написание с буквой «ю» после «д» — результат мягкого произношения в диалектах: Павдюря, а не Павдуря. Таким образом, фамилия Павдюрин — редкий пример того, как простое имя обрастает региональными чертами и застывает в виде фамилии, указывая на южнорусские корни предков.