Фамилия Пебруева — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного суффикса -ов/-ев в мужской форме (Пебруев), но есть окончание -а, указывающее на женскую ветвь рода или на то, что перед нами форма, закрепившаяся в документах через жену или дочь. Основа «Пебру-» звучит нерусски и заставляет искать корни за пределами славянского языкового массива.

Самая вероятная версия — связь с финно-угорскими языками, в частности с коми или удмуртским. В этих языках «пеб» или «пебру» может означать что-то вроде «горб», «бугор» или «выпуклость». Сравните с коми «пебӧс» — «горбатый» или «сутулый». Тогда прозвище Пебруй (или Пебру) давали человеку с характерной осанкой, сгорбленному или сутулому. Суффикс -ев в мужском варианте указывает на принадлежность: «сын Пебруя» или «из рода Пебруя». Фамилия могла возникнуть в северных или приуральских регионах, где русские переселенцы контактировали с местным населением и заимствовали прозвища.

Менее правдоподобная, но возможная гипотеза — искажение более распространенной фамилии. Например, Пебруева могла возникнуть из Пеброва (от имени Пётр через диалектное «Пебро») или из Пеструева (от прозвища Пеструй, «пёстрый»). Однако в таком случае сохранилось бы больше вариантов в документах, а Пебруева — слишком специфична для случайной описки.

Географически фамилия почти не встречается в центральных областях России. Единичные носители зафиксированы в Пермском крае и Удмуртии, что косвенно подтверждает финно-угорскую версию. Сословно предки Пебруевых, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, возможно, охотниками или рыбаками — в среде, где прозвища по внешним признакам давали легко и они закреплялись как фамилии.

Разбор суффикса здесь ключевой: -ев, а не -ов, указывает на основу, оканчивающуюся на мягкий согласный или й. Если исходное прозвище звучало как Пебруй, то форма Пебруев абсолютно регулярна. В женском варианте Пебруева сохранился тот же корень, но с окончанием, указывающим на женщину — либо как на жену Пебруева, либо как на дочь, если фамилия оформлялась через отчество.