Фамилия Пекпатрова — редкий случай, когда основа очевидна, а происхождение неожиданно. На первый взгляд кажется, что перед нами сложное слово с корнем «пек-» (от «печь», «пекло» или диалектного «пек» — жар, зной) и отчеством «Патрова» (дочь Патра). Но в русской ономастике такие конструкции почти не встречаются: фамилии не склеивали из двух самостоятельных частей, где вторая — уже готовая фамилия или отчество.

Вероятнее всего, Пекпатрова — это результат искажения или сращения при переписи. Исходная форма могла звучать как Пек-Патрова или Пекпатров, где первая часть — прозвище или указание на занятие. «Пек» в северных и сибирских говорах означало не только жар, но и смолу, вар, а также человека, который варит смолу или дёготь (смолокур, дегтяр). Вторая часть, «Патров», — это вариант фамилии Петров, распространённый в старообрядческой среде и на Русском Севере (Архангельская, Вологодская губернии). Там «а» вместо «е» в корне — обычное диалектное явление: Патра вместо Петра.

Таким образом, Пекпатрова могла появиться как прозвище «Пек-Патров» — «смолокур Петров» или «Петров-смолокур». Со временем дефис исчез, и фамилия слилась в одно слово. Женская форма на -а указывает, что в современном виде фамилия закрепилась за женщиной (например, при замужестве или при записи детей по матери). Носительница такой фамилии, скорее всего, происходит из семей потомственных смолокуров или дегтярей, живших в лесных районах Русского Севера или Урала.

Других версий, объясняющих фамилию через тюркские или финно-угорские корни, нет: звучание «пек» в тюркских языках означает «крепкий», «прочный», но сочетание с «Патров» не даёт осмысленной конструкции. Поэтому самая правдоподобная гипотеза — русская диалектная основа с профессиональным оттенком, зафиксированная в редкой сращённой форме.