Фамилия Пекушкин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Пекушкин, вероятно, образована от прозвища Пекушка, которое предположительно восходит к глаголу «печь». Таким образом, прозвище Пекушка может относиться к профессиональным именованиям, указывающим на род деятельности предка. Скорее всего, он был пекарем. Менее вероятно, что прозвище Пекушка связано с глаголом «печься» в значении «заботиться, ходатайствовать». В этом случае Пекушкой могли нарекать того, кто заметно пёкся о себе или о других. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пекушка, со временем получил фамилию Пекушкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Пекушкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Пекушкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.