Фамилия Пендряк звучит редко и сразу обращает на себя внимание нестандартным суффиксом. В русской ономастике преобладают фамилии на -ов, -ин, -ский, а здесь мы видим типично украинский или южнорусский суффикс -як. Он указывает на то, что носитель фамилии или его прямой предок происходил с территории современной Украины или юга России, где такие окончания встречаются часто (Грицак, Костяк, Писарчук, но через -як). Основа фамилии — «Пендр-», и здесь начинается самое интересное.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Пендря или Пендро. В украинских говорах слово «пендря» могло означать нечто вроде «задира», «забияка» или «непоседа» — человека, который постоянно «пентюхается», то есть суетится, мешает, путается под ногами. Есть и другая, более прозаичная версия: «пендря» — это диалектное название невысокого, коренастого человека, либо того, кто ходит вразвалку, «пендряет». В любом случае, прозвище носило характерный, бытовой оттенок и давалось по внешности или поведению.

Менее вероятна, но возможна связь с польским или белорусским словом «pędrak» — так называли личинку насекомого, а в переносном смысле — маленького, юркого мальчишку. Если фамилия пришла с запада, то её носитель мог получить прозвище за низкий рост или подвижность. Однако суффикс -як всё же крепче привязывает фамилию к украинской традиции, где он активно использовался для образования фамилий от личных прозвищ.

В писцовых книгах и ревизских сказках фамилия Пендряк не зафиксирована в массовом порядке, что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, она возникла в среде казачества или крестьянства на территории Полтавщины, Черниговщины или Харьковщины. Сословно это однозначно не дворянская фамилия — она образована от простонародного прозвища, а не от имени или названия поместья. Носитель такой фамилии мог быть ремесленником, мелким торговцем или вольным хлеборобом.

Если пытаться угадать по звучанию, то фамилия Пендряк могла записываться по-разному: Пендряк, Пендряков (если русифицировали), Пендряченко, Пендр. Встречаются однокоренные фамилии Пендюра, Пендюх, Пендрик — все они держатся на одной основе и указывают на южное, скорее всего украинское, происхождение рода.