Фамилия Пердевожа — редкий и яркий пример русской фамилии-прозвища, образованной от глагольной основы. В её основе лежит повелительное наклонение глагола «пердеть» (издавать газы) в сочетании с существительным «вожак» или «вожа» (вожак, предводитель). Буквально прозвище Пердевожа означало «командир, который пердит» или, в более грубой и прямой интерпретации, «тот, кто пукает громче всех и ведёт за собой». Такие конструкции с глаголом в повелительном наклонении и дополнением характерны для древнерусских охранительных и насмешливых имён: вспомните Держиморду, Скалозуба, Горихвостова. Фамилия закрепляла за человеком комичную или унизительную черту, но в среде, где такие прозвища давали без злобы, она могла быть просто констатацией физиологической особенности.

Суффикс -а в конце фамилии — не окончание женского рода, а часть основы слова «вожа». Фамилия склоняется как существительное мужского рода: Пердевожа, Пердевожи, Пердевожу. Окончание -а в именительном падеже может вводить в заблуждение, но это типично для прозвищ, перешедших в фамилии без дополнительных суффиксов (сравните: Шумиголова, Вертихвост). Никакой географической привязки у фамилии нет — она встречается единично и не образует гнёзд в традиционных крестьянских регионах. Скорее всего, она возникла в среде, где ценилась прямота и юмор: среди казаков, бурлаков, ремесленников или вольных крестьян северных областей, где фамилии-прозвища бытовали дольше.

Версия о том, что основа связана с древнерусским «пьрдѣти» (издавать звук) и «вожь» (вождь), не оставляет сомнений в семантике. Альтернативное объяснение — от тюркского «перде» (занавес, ширма) — маловероятно, так как фамилия явно славянская по модели образования и не имеет суффикса -ов или -ин, типичного для тюркских заимствований. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные конструкции описываются как «фамилии-предложения» (например, Убейкобыла), и Пердевожа попадает в эту же категорию. Носитель такой фамилии мог быть либо человеком с громким пищеварением, либо, что вероятнее, получил прозвище в насмешку за неуклюжесть или хвастовство — вожака, который «выпускает пар» не вовремя.