Фамилия Пейпиньш — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка лежит за пределами славянского мира. Если фамилия заканчивается на -иныш, -иня, -итис, это типичный балтийский след, а именно латышский или, реже, литовский. В латышском языке суффикс -iņš (читается как «иньш») — уменьшительно-ласкательный, примерно как русские -ик, -чик, -ёк. Он образует фамилии от личных имён, прозвищ или профессий. Пейпиньш, скорее всего, восходит к основе Пейпа или Пейпс. В латышском «peips» — это «пескарь» (рыба). Тогда Пейпиньш — буквально «пескарик», «маленький пескарь». Прозвище могли дать рыбаку, человеку, похожему на эту юркую рыбку, или, что реже, жителю у воды, где водился пескарь. Есть и другая, менее вероятная версия: «peips» в некоторых говорах могло означать «пень», «коряга» — тогда прозвище относилось к человеку крепкому, коренастому. Фамилия Пейпиньш — типичный пример латышской модели фамилии, закреплённой в XIX веке, когда крестьяне получили обязательные фамилии. В современной России такая фамилия встречается единично, чаще всего у потомков латышских переселенцев, которые в разное время оказывались в Сибири, на Дальнем Востоке или в центральных губерниях.