Фамилия Пидтоптаная звучит непривычно для русского уха, но для украинского языка она абсолютно прозрачна. Это типичная украинская фамилия, образованная от глагола «підтоптати» — «подтоптать», «примять ногами». В основе лежит прозвище Підтоптаний, которое давали человеку с характерной походкой — возможно, тому, кто ходил вразвалку, шаркал или «подбивал» подошву, оставляя след. Другая, более прозаичная версия: так могли назвать крестьянина, который работал в поле и «приминал» траву или посевы.

Словообразовательная модель фамилии — суффикс -ан- (-ан-) с окончанием -ая, что указывает на женский род в исходном прозвище. В украинской традиции фамилии на -ая (-а) нередко закреплялись за женщинами (например, вдовами) или передавались по материнской линии, но со временем стали родовыми. Если бы фамилия была мужской, она звучала бы как Пидтоптаный. В русском языке подобная модель встречается реже, поэтому фамилия сразу выдает украинское происхождение — скорее всего, с Левобережья, Полтавщины или Черниговщины.

Корень «топт-» (топтати) — старый, общеславянский, связанный с действием ног. В украинских говорах есть и слово «підтоптаний» в переносном смысле — «пожилой», «потрепанный жизнью», то есть прозвище могло относиться к человеку в возрасте или уставшему от труда. Однако прямое значение — «примятый», «утоптанный» — всё же первично.

Среди однокоренных фамилий — Топтало, Топтун, Подтоптанный (русский вариант). Пидтоптаная стоит особняком из-за редкого суффикса и окончания. Встречается она нечасто, в основном в центральных и восточных областях Украины. В России такая фамилия — редкость, и её обладатели почти наверняка имеют украинские корни.

Исторически носители фамилии были, скорее всего, крестьянами или казаками — людьми, чья жизнь проходила на ногах, в поле или на дороге. Никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В советское время фамилия могла видоизмениться: часть носителей «обрусела» до Подтоптаная, но оригинальное написание сохранилось у тех, кто помнил свои корни.